在签订电商代运营合作协议时，需要注意以下几个关键条款：

1、明确服务标准：合同中应详细约定代运营服务的量化标准或评判标准，如视觉设计、产品管理、流量运营、活动策划、会员设置、内容营销、仓储物流、粉丝增量和销售额指标等，这些标准的设定有助于双方对服务质量有明确的预期，并在发生争议时提供判断依据。

2、解除权及退费方式：合同中应明确双方的解除权及非正常结束合作时的退费结算方式，这包括正常的结束合作情形和非正常结束合作的情形，以及在这些情况下双方的权利和义务。

3、投流费用预算：需要明确投流费用的预算、负担主体、投流的时间等内容，这有助于避免因广告投放产生的额外成本而导致的纠纷。

4、责任承担：合同中应明确代运营机构给店铺带来损失后的责任承担方式，需要明确哪些行为属于禁止行为，以及在造成损害后的赔偿责任。

5、所有权及知识产权归属：除了约定店铺所有权的归属外，还需要明确在代运营期间宣传推广作品的知识产权归属问题，这对于保护品牌方的知识产权至关重要。

6、货品质量与上架决策：需要约定货品的质量、成本、上架的决定方及责任方，这是确保网店商品质量和供应链管理的关键。

7、合同性质：根据双方的实际情况，考虑将合同定性为委托合同，以便品牌方在合作过程中拥有更大的主动权。

8、合作费用：明确合作费用的构成、支付方式、收益分配等，这有助于避免因财务问题导致的合作纠纷。

9、知识产权约定：在合同中约定知识产权侵权风险的分担、网店页面设计的著作权归属、商业标识的权属等问题，这对于保护品牌方的知识产权和商业秘密至关重要。

10、合同提前解除：考虑到合作可能出现的问题，合同中应包含提前解除合同的条件和程序，以及解除合同后的善后处理，如库存产品处理、数据和文件资料移交等。

签订电商代运营合作协议时，应充分考虑上述条款，以确保双方的权益得到妥善保护，建议在签订合同前咨询专业法律人士的意见，以确保合同的合法性和有效性。